Stosowana w Niemczech naturopatia dąży możliwie do rezygnacji z leków chemicznych i wspiera samouzdrawiającą siłę organizmu naturalnymi środkami i terapiami. Metody leczenia są bardzo zróżnicowane – to, czy i jakie leczenie naturopatyczne jest godne polecenia, zależy od stanu pacjenta i jego obrazu klinicznego. Bardzo ważne jest, aby pacjent świadomie i aktywnie uczestniczył w procesie leczenia.
W procesie leczenia ważną rolę odgrywają w szczególności światło, powietrze, ruch, odpoczynek, jedzenie, oddychanie i emocje. Klasyczne obszary naturopatii obejmują zatem ziołolecznictwo, terapię wodną, terapię ruchową, terapię żywieniową i terapię porządkową. W szerszym znaczeniu obejmują one również homeopatię, tradycyjną medycynę chińską (TCM) i medycynę ajurwedyjską.
Terapeuci naturopatyczni są często lekarzami, którzy po ukończeniu specjalizacji lekarskiej przeszli obszerne dokształcanie i otrzymali oficjalny dodatkowy tytuł „leczenie naturopatyczne” nadany przez niemiecką izbę lekarską. Ponadto w Niemczech istnieje zawód państwowo zaprzysiężonego lekarza medycyny alternatywnej, który nie musi być licencjonowanym lekarzem, ale po kilku latach kształcenia zdał egzamin państwowy.